Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trip11E9Q512 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trip11E9Q512 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Trip11E9Q512 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trip11E9Q512 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trip11E9Q512 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trip11E9Q512 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trip11E9Q512 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trip11E9Q512 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trip11E9Q512 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trip11E9Q512 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trip11E9Q512 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trip11E9Q512 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trip11E9Q512 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trip11E9Q512 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trip11E9Q512 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trip11E9Q512 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trip11E9Q512 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trip11E9Q512 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trip11E9Q512 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trip11E9Q512 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trip11E9Q512 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trip11E9Q512 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trip11E9Q512 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trip11E9Q512 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trip11E9Q512 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trip11E9Q512 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trip11E9Q512 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trip11E9Q512 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Trip11E9Q512 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Trip11E9Q512 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trip11E9Q512 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trip11E9Q512 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trip11E9Q512 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trip11E9Q512 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trip11E9Q512 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trip11E9Q512 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trip11E9Q512 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trip11E9Q512 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trip11E9Q512 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trip11E9Q512 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trip11E9Q512 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Trip11E9Q512 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trip11E9Q512 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trip11E9Q512 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trip11E9Q512 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Trip11E9Q512 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trip11E9Q512 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trip11E9Q512 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Trip11E9Q512 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trip11E9Q512 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trip11E9Q512 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trip11E9Q512 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trip11E9Q512 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trip11E9Q512 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trip11E9Q512 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trip11E9Q512 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Trip11E9Q512 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trip11E9Q512 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trip11E9Q512 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trip11E9Q512 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trip11E9Q512 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trip11E9Q512 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trip11E9Q512 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trip11E9Q512 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trip11E9Q512 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trip11E9Q512 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trip11E9Q512 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trip11E9Q512 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trip11E9Q512 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trip11E9Q512 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trip11E9Q512 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trip11E9Q512 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trip11E9Q512 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trip11E9Q512 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trip11E9Q512 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Trip11E9Q512 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trip11E9Q512 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trip11E9Q512 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trip11E9Q512 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trip11E9Q512 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trip11E9Q512 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trip11E9Q512 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trip11E9Q512 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trip11E9Q512 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trip11E9Q512 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trip11E9Q512 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trip11E9Q512 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trip11E9Q512 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trip11E9Q512 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Trip11E9Q512 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trip11E9Q512 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trip11E9Q512 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trip11E9Q512 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trip11E9Q512 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trip11E9Q512 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trip11E9Q512 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Trip11E9Q512 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trip11E9Q512 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trip11E9Q512 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms