Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc171E9Q1U1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc171E9Q1U1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc171E9Q1U1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc171E9Q1U1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc171E9Q1U1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc171E9Q1U1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc171E9Q1U1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc171E9Q1U1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc171E9Q1U1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc171E9Q1U1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc171E9Q1U1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc171E9Q1U1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc171E9Q1U1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc171E9Q1U1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc171E9Q1U1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc171E9Q1U1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc171E9Q1U1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc171E9Q1U1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc171E9Q1U1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc171E9Q1U1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc171E9Q1U1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc171E9Q1U1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc171E9Q1U1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc171E9Q1U1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc171E9Q1U1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc171E9Q1U1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc171E9Q1U1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc171E9Q1U1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc171E9Q1U1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc171E9Q1U1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc171E9Q1U1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc171E9Q1U1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc171E9Q1U1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc171E9Q1U1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc171E9Q1U1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc171E9Q1U1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc171E9Q1U1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc171E9Q1U1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc171E9Q1U1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc171E9Q1U1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc171E9Q1U1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc171E9Q1U1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc171E9Q1U1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc171E9Q1U1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc171E9Q1U1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc171E9Q1U1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc171E9Q1U1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc171E9Q1U1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc171E9Q1U1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc171E9Q1U1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc171E9Q1U1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc171E9Q1U1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc171E9Q1U1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc171E9Q1U1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc171E9Q1U1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc171E9Q1U1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc171E9Q1U1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc171E9Q1U1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc171E9Q1U1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc171E9Q1U1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc171E9Q1U1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
Ccdc171E9Q1U1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc171E9Q1U1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc171E9Q1U1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc171E9Q1U1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc171E9Q1U1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc171E9Q1U1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc171E9Q1U1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc171E9Q1U1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc171E9Q1U1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc171E9Q1U1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc171E9Q1U1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc171E9Q1U1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc171E9Q1U1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc171E9Q1U1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc171E9Q1U1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc171E9Q1U1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc171E9Q1U1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc171E9Q1U1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc171E9Q1U1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc171E9Q1U1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc171E9Q1U1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc171E9Q1U1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc171E9Q1U1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc171E9Q1U1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc171E9Q1U1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc171E9Q1U1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc171E9Q1U1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc171E9Q1U1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc171E9Q1U1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc171E9Q1U1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc171E9Q1U1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc171E9Q1U1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc171E9Q1U1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc171E9Q1U1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc171E9Q1U1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc171E9Q1U1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc171E9Q1U1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc171E9Q1U1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
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