Protein–RNA interactions for Protein: E9PWI7

C87414, Expressed sequence C87414, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87414E9PWI7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C87414E9PWI7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C87414E9PWI7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
C87414E9PWI7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C87414E9PWI7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C87414E9PWI7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C87414E9PWI7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C87414E9PWI7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C87414E9PWI7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C87414E9PWI7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C87414E9PWI7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C87414E9PWI7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C87414E9PWI7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C87414E9PWI7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C87414E9PWI7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
C87414E9PWI7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C87414E9PWI7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C87414E9PWI7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C87414E9PWI7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C87414E9PWI7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C87414E9PWI7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C87414E9PWI7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C87414E9PWI7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C87414E9PWI7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C87414E9PWI7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C87414E9PWI7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C87414E9PWI7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C87414E9PWI7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
C87414E9PWI7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C87414E9PWI7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C87414E9PWI7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C87414E9PWI7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C87414E9PWI7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C87414E9PWI7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C87414E9PWI7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C87414E9PWI7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C87414E9PWI7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C87414E9PWI7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C87414E9PWI7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C87414E9PWI7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C87414E9PWI7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C87414E9PWI7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C87414E9PWI7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C87414E9PWI7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C87414E9PWI7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C87414E9PWI7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C87414E9PWI7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C87414E9PWI7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C87414E9PWI7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C87414E9PWI7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C87414E9PWI7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C87414E9PWI7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C87414E9PWI7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C87414E9PWI7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C87414E9PWI7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C87414E9PWI7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C87414E9PWI7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C87414E9PWI7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C87414E9PWI7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C87414E9PWI7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C87414E9PWI7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C87414E9PWI7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C87414E9PWI7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C87414E9PWI7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C87414E9PWI7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C87414E9PWI7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C87414E9PWI7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C87414E9PWI7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C87414E9PWI7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C87414E9PWI7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C87414E9PWI7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C87414E9PWI7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C87414E9PWI7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C87414E9PWI7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C87414E9PWI7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C87414E9PWI7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C87414E9PWI7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C87414E9PWI7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C87414E9PWI7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C87414E9PWI7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C87414E9PWI7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
C87414E9PWI7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C87414E9PWI7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
C87414E9PWI7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C87414E9PWI7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C87414E9PWI7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C87414E9PWI7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C87414E9PWI7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C87414E9PWI7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.3■■□□□ 1
C87414E9PWI7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C87414E9PWI7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C87414E9PWI7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C87414E9PWI7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C87414E9PWI7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C87414E9PWI7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C87414E9PWI7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C87414E9PWI7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C87414E9PWI7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C87414E9PWI7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C87414E9PWI7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.8 ms