Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc175E9PVB3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc175E9PVB3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc175E9PVB3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc175E9PVB3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc175E9PVB3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc175E9PVB3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc175E9PVB3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc175E9PVB3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc175E9PVB3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc175E9PVB3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc175E9PVB3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc175E9PVB3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc175E9PVB3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc175E9PVB3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc175E9PVB3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc175E9PVB3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc175E9PVB3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc175E9PVB3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc175E9PVB3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc175E9PVB3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc175E9PVB3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc175E9PVB3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc175E9PVB3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc175E9PVB3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc175E9PVB3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc175E9PVB3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc175E9PVB3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc175E9PVB3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc175E9PVB3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc175E9PVB3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc175E9PVB3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc175E9PVB3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc175E9PVB3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc175E9PVB3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc175E9PVB3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc175E9PVB3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc175E9PVB3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc175E9PVB3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc175E9PVB3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc175E9PVB3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc175E9PVB3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc175E9PVB3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc175E9PVB3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc175E9PVB3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc175E9PVB3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc175E9PVB3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc175E9PVB3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc175E9PVB3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc175E9PVB3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc175E9PVB3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc175E9PVB3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc175E9PVB3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc175E9PVB3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc175E9PVB3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc175E9PVB3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc175E9PVB3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc175E9PVB3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc175E9PVB3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc175E9PVB3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc175E9PVB3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc175E9PVB3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc175E9PVB3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc175E9PVB3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc175E9PVB3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc175E9PVB3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc175E9PVB3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc175E9PVB3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc175E9PVB3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc175E9PVB3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc175E9PVB3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc175E9PVB3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc175E9PVB3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc175E9PVB3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc175E9PVB3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc175E9PVB3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc175E9PVB3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc175E9PVB3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc175E9PVB3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc175E9PVB3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc175E9PVB3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc175E9PVB3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc175E9PVB3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc175E9PVB3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc175E9PVB3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc175E9PVB3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc175E9PVB3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc175E9PVB3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc175E9PVB3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc175E9PVB3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc175E9PVB3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc175E9PVB3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc175E9PVB3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc175E9PVB3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc175E9PVB3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc175E9PVB3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc175E9PVB3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc175E9PVB3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc175E9PVB3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc175E9PVB3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.8 ms