Protein–RNA interactions for Protein: E9PUU5

Zfp839, Zinc finger protein 839, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp839E9PUU5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp839E9PUU5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp839E9PUU5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp839E9PUU5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp839E9PUU5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp839E9PUU5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp839E9PUU5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp839E9PUU5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp839E9PUU5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp839E9PUU5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp839E9PUU5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp839E9PUU5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp839E9PUU5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp839E9PUU5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp839E9PUU5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp839E9PUU5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp839E9PUU5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp839E9PUU5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp839E9PUU5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp839E9PUU5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp839E9PUU5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp839E9PUU5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp839E9PUU5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp839E9PUU5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp839E9PUU5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp839E9PUU5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp839E9PUU5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zfp839E9PUU5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp839E9PUU5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp839E9PUU5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp839E9PUU5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp839E9PUU5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp839E9PUU5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp839E9PUU5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp839E9PUU5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp839E9PUU5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp839E9PUU5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp839E9PUU5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp839E9PUU5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp839E9PUU5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp839E9PUU5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp839E9PUU5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp839E9PUU5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp839E9PUU5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp839E9PUU5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp839E9PUU5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp839E9PUU5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp839E9PUU5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp839E9PUU5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp839E9PUU5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp839E9PUU5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp839E9PUU5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp839E9PUU5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp839E9PUU5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp839E9PUU5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp839E9PUU5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp839E9PUU5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp839E9PUU5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp839E9PUU5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp839E9PUU5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp839E9PUU5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp839E9PUU5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp839E9PUU5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp839E9PUU5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp839E9PUU5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp839E9PUU5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp839E9PUU5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp839E9PUU5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zfp839E9PUU5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zfp839E9PUU5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zfp839E9PUU5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zfp839E9PUU5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp839E9PUU5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp839E9PUU5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp839E9PUU5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp839E9PUU5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp839E9PUU5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Zfp839E9PUU5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp839E9PUU5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp839E9PUU5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp839E9PUU5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp839E9PUU5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp839E9PUU5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp839E9PUU5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp839E9PUU5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp839E9PUU5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp839E9PUU5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp839E9PUU5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp839E9PUU5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp839E9PUU5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp839E9PUU5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp839E9PUU5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp839E9PUU5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp839E9PUU5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp839E9PUU5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp839E9PUU5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp839E9PUU5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp839E9PUU5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp839E9PUU5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp839E9PUU5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms