Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
3425401B19RikD3Z1D3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
3425401B19RikD3Z1D3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
3425401B19RikD3Z1D3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
3425401B19RikD3Z1D3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
3425401B19RikD3Z1D3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
3425401B19RikD3Z1D3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
3425401B19RikD3Z1D3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
3425401B19RikD3Z1D3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
3425401B19RikD3Z1D3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
3425401B19RikD3Z1D3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
3425401B19RikD3Z1D3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
3425401B19RikD3Z1D3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
3425401B19RikD3Z1D3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
3425401B19RikD3Z1D3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
3425401B19RikD3Z1D3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
3425401B19RikD3Z1D3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
3425401B19RikD3Z1D3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
3425401B19RikD3Z1D3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
3425401B19RikD3Z1D3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
3425401B19RikD3Z1D3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
3425401B19RikD3Z1D3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
3425401B19RikD3Z1D3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
3425401B19RikD3Z1D3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
3425401B19RikD3Z1D3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
3425401B19RikD3Z1D3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
3425401B19RikD3Z1D3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
3425401B19RikD3Z1D3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
3425401B19RikD3Z1D3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
3425401B19RikD3Z1D3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
3425401B19RikD3Z1D3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
3425401B19RikD3Z1D3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
3425401B19RikD3Z1D3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
3425401B19RikD3Z1D3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
3425401B19RikD3Z1D3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
3425401B19RikD3Z1D3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
3425401B19RikD3Z1D3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
3425401B19RikD3Z1D3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
3425401B19RikD3Z1D3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
3425401B19RikD3Z1D3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
3425401B19RikD3Z1D3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
3425401B19RikD3Z1D3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
3425401B19RikD3Z1D3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
3425401B19RikD3Z1D3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
3425401B19RikD3Z1D3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
3425401B19RikD3Z1D3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
3425401B19RikD3Z1D3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
3425401B19RikD3Z1D3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
3425401B19RikD3Z1D3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
3425401B19RikD3Z1D3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
3425401B19RikD3Z1D3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
3425401B19RikD3Z1D3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
3425401B19RikD3Z1D3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
3425401B19RikD3Z1D3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
3425401B19RikD3Z1D3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
3425401B19RikD3Z1D3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
3425401B19RikD3Z1D3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
3425401B19RikD3Z1D3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
3425401B19RikD3Z1D3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
3425401B19RikD3Z1D3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
3425401B19RikD3Z1D3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
3425401B19RikD3Z1D3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
3425401B19RikD3Z1D3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
3425401B19RikD3Z1D3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
3425401B19RikD3Z1D3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
3425401B19RikD3Z1D3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
3425401B19RikD3Z1D3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
3425401B19RikD3Z1D3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
3425401B19RikD3Z1D3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
3425401B19RikD3Z1D3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
3425401B19RikD3Z1D3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
3425401B19RikD3Z1D3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
3425401B19RikD3Z1D3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
3425401B19RikD3Z1D3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
3425401B19RikD3Z1D3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
3425401B19RikD3Z1D3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
3425401B19RikD3Z1D3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
3425401B19RikD3Z1D3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
3425401B19RikD3Z1D3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
3425401B19RikD3Z1D3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
3425401B19RikD3Z1D3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
3425401B19RikD3Z1D3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
3425401B19RikD3Z1D3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
3425401B19RikD3Z1D3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
3425401B19RikD3Z1D3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
3425401B19RikD3Z1D3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
3425401B19RikD3Z1D3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
3425401B19RikD3Z1D3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
3425401B19RikD3Z1D3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
3425401B19RikD3Z1D3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
3425401B19RikD3Z1D3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
3425401B19RikD3Z1D3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
3425401B19RikD3Z1D3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
3425401B19RikD3Z1D3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
3425401B19RikD3Z1D3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
3425401B19RikD3Z1D3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
3425401B19RikD3Z1D3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
3425401B19RikD3Z1D3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
3425401B19RikD3Z1D3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms