Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rfx8D3YU81 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rfx8D3YU81 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rfx8D3YU81 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rfx8D3YU81 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rfx8D3YU81 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rfx8D3YU81 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rfx8D3YU81 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Rfx8D3YU81 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rfx8D3YU81 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rfx8D3YU81 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rfx8D3YU81 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rfx8D3YU81 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rfx8D3YU81 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Rfx8D3YU81 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rfx8D3YU81 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rfx8D3YU81 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rfx8D3YU81 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rfx8D3YU81 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rfx8D3YU81 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rfx8D3YU81 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rfx8D3YU81 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rfx8D3YU81 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rfx8D3YU81 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rfx8D3YU81 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rfx8D3YU81 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rfx8D3YU81 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rfx8D3YU81 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rfx8D3YU81 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rfx8D3YU81 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rfx8D3YU81 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rfx8D3YU81 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rfx8D3YU81 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rfx8D3YU81 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rfx8D3YU81 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rfx8D3YU81 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rfx8D3YU81 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rfx8D3YU81 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rfx8D3YU81 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Rfx8D3YU81 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Rfx8D3YU81 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rfx8D3YU81 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rfx8D3YU81 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rfx8D3YU81 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rfx8D3YU81 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rfx8D3YU81 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rfx8D3YU81 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rfx8D3YU81 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rfx8D3YU81 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rfx8D3YU81 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rfx8D3YU81 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rfx8D3YU81 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfx8D3YU81 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfx8D3YU81 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfx8D3YU81 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfx8D3YU81 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfx8D3YU81 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rfx8D3YU81 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rfx8D3YU81 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rfx8D3YU81 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rfx8D3YU81 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rfx8D3YU81 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rfx8D3YU81 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfx8D3YU81 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfx8D3YU81 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfx8D3YU81 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfx8D3YU81 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfx8D3YU81 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfx8D3YU81 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfx8D3YU81 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfx8D3YU81 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfx8D3YU81 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfx8D3YU81 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfx8D3YU81 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rfx8D3YU81 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rfx8D3YU81 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rfx8D3YU81 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rfx8D3YU81 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rfx8D3YU81 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rfx8D3YU81 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rfx8D3YU81 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rfx8D3YU81 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rfx8D3YU81 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rfx8D3YU81 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rfx8D3YU81 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rfx8D3YU81 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rfx8D3YU81 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rfx8D3YU81 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rfx8D3YU81 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rfx8D3YU81 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rfx8D3YU81 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rfx8D3YU81 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rfx8D3YU81 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rfx8D3YU81 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rfx8D3YU81 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rfx8D3YU81 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rfx8D3YU81 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rfx8D3YU81 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rfx8D3YU81 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rfx8D3YU81 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms