Protein–RNA interactions for Protein: B1ATX6

Fam46d, Family with sequence similarity 46, member D, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam46dB1ATX6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fam46dB1ATX6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fam46dB1ATX6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fam46dB1ATX6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fam46dB1ATX6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fam46dB1ATX6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fam46dB1ATX6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fam46dB1ATX6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fam46dB1ATX6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fam46dB1ATX6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fam46dB1ATX6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fam46dB1ATX6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fam46dB1ATX6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fam46dB1ATX6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fam46dB1ATX6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fam46dB1ATX6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fam46dB1ATX6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fam46dB1ATX6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fam46dB1ATX6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fam46dB1ATX6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fam46dB1ATX6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fam46dB1ATX6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fam46dB1ATX6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fam46dB1ATX6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fam46dB1ATX6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fam46dB1ATX6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fam46dB1ATX6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fam46dB1ATX6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fam46dB1ATX6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fam46dB1ATX6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fam46dB1ATX6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fam46dB1ATX6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fam46dB1ATX6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fam46dB1ATX6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fam46dB1ATX6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Fam46dB1ATX6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fam46dB1ATX6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fam46dB1ATX6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fam46dB1ATX6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fam46dB1ATX6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fam46dB1ATX6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fam46dB1ATX6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fam46dB1ATX6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fam46dB1ATX6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fam46dB1ATX6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Fam46dB1ATX6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fam46dB1ATX6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fam46dB1ATX6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fam46dB1ATX6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Fam46dB1ATX6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fam46dB1ATX6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fam46dB1ATX6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fam46dB1ATX6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fam46dB1ATX6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fam46dB1ATX6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fam46dB1ATX6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fam46dB1ATX6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fam46dB1ATX6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fam46dB1ATX6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Fam46dB1ATX6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fam46dB1ATX6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fam46dB1ATX6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fam46dB1ATX6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fam46dB1ATX6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fam46dB1ATX6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fam46dB1ATX6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fam46dB1ATX6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fam46dB1ATX6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fam46dB1ATX6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fam46dB1ATX6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam46dB1ATX6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam46dB1ATX6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam46dB1ATX6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam46dB1ATX6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam46dB1ATX6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam46dB1ATX6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam46dB1ATX6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam46dB1ATX6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam46dB1ATX6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam46dB1ATX6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam46dB1ATX6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam46dB1ATX6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam46dB1ATX6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam46dB1ATX6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam46dB1ATX6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam46dB1ATX6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam46dB1ATX6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam46dB1ATX6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Fam46dB1ATX6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Fam46dB1ATX6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Fam46dB1ATX6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam46dB1ATX6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam46dB1ATX6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam46dB1ATX6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam46dB1ATX6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam46dB1ATX6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam46dB1ATX6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam46dB1ATX6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam46dB1ATX6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam46dB1ATX6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms