Protein–RNA interactions for Protein: A6H6T1

Prss40, Serine protease 40, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss40A6H6T1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Prss40A6H6T1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Prss40A6H6T1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prss40A6H6T1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prss40A6H6T1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prss40A6H6T1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Prss40A6H6T1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Prss40A6H6T1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prss40A6H6T1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prss40A6H6T1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prss40A6H6T1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prss40A6H6T1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prss40A6H6T1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prss40A6H6T1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prss40A6H6T1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prss40A6H6T1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prss40A6H6T1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prss40A6H6T1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prss40A6H6T1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prss40A6H6T1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Prss40A6H6T1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prss40A6H6T1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prss40A6H6T1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prss40A6H6T1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prss40A6H6T1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prss40A6H6T1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prss40A6H6T1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prss40A6H6T1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prss40A6H6T1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prss40A6H6T1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Prss40A6H6T1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prss40A6H6T1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prss40A6H6T1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prss40A6H6T1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prss40A6H6T1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prss40A6H6T1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prss40A6H6T1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prss40A6H6T1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prss40A6H6T1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prss40A6H6T1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prss40A6H6T1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prss40A6H6T1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prss40A6H6T1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prss40A6H6T1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prss40A6H6T1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prss40A6H6T1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prss40A6H6T1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Prss40A6H6T1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prss40A6H6T1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prss40A6H6T1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Prss40A6H6T1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prss40A6H6T1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prss40A6H6T1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prss40A6H6T1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prss40A6H6T1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prss40A6H6T1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prss40A6H6T1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prss40A6H6T1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prss40A6H6T1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prss40A6H6T1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prss40A6H6T1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prss40A6H6T1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prss40A6H6T1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prss40A6H6T1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prss40A6H6T1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prss40A6H6T1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prss40A6H6T1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prss40A6H6T1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prss40A6H6T1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Prss40A6H6T1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prss40A6H6T1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prss40A6H6T1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prss40A6H6T1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prss40A6H6T1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prss40A6H6T1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prss40A6H6T1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prss40A6H6T1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prss40A6H6T1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prss40A6H6T1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prss40A6H6T1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prss40A6H6T1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prss40A6H6T1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prss40A6H6T1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prss40A6H6T1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prss40A6H6T1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prss40A6H6T1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prss40A6H6T1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prss40A6H6T1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prss40A6H6T1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prss40A6H6T1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prss40A6H6T1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prss40A6H6T1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prss40A6H6T1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prss40A6H6T1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Prss40A6H6T1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prss40A6H6T1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prss40A6H6T1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prss40A6H6T1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prss40A6H6T1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prss40A6H6T1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms