Protein–RNA interactions for Protein: A2A958

C87977, Expressed sequence C87977, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87977A2A958 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C87977A2A958 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C87977A2A958 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C87977A2A958 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C87977A2A958 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C87977A2A958 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C87977A2A958 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C87977A2A958 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C87977A2A958 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C87977A2A958 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C87977A2A958 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C87977A2A958 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C87977A2A958 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C87977A2A958 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C87977A2A958 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C87977A2A958 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C87977A2A958 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C87977A2A958 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C87977A2A958 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C87977A2A958 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C87977A2A958 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C87977A2A958 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C87977A2A958 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C87977A2A958 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C87977A2A958 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C87977A2A958 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C87977A2A958 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C87977A2A958 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C87977A2A958 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C87977A2A958 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C87977A2A958 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C87977A2A958 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C87977A2A958 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C87977A2A958 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C87977A2A958 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C87977A2A958 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C87977A2A958 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C87977A2A958 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C87977A2A958 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C87977A2A958 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C87977A2A958 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C87977A2A958 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C87977A2A958 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C87977A2A958 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C87977A2A958 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
C87977A2A958 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
C87977A2A958 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C87977A2A958 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C87977A2A958 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C87977A2A958 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C87977A2A958 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C87977A2A958 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C87977A2A958 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C87977A2A958 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C87977A2A958 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C87977A2A958 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
C87977A2A958 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C87977A2A958 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C87977A2A958 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C87977A2A958 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C87977A2A958 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C87977A2A958 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C87977A2A958 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C87977A2A958 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C87977A2A958 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C87977A2A958 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
C87977A2A958 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C87977A2A958 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C87977A2A958 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C87977A2A958 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C87977A2A958 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C87977A2A958 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C87977A2A958 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C87977A2A958 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C87977A2A958 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C87977A2A958 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C87977A2A958 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C87977A2A958 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C87977A2A958 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C87977A2A958 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C87977A2A958 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C87977A2A958 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C87977A2A958 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C87977A2A958 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C87977A2A958 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C87977A2A958 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C87977A2A958 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C87977A2A958 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C87977A2A958 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C87977A2A958 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C87977A2A958 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
C87977A2A958 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C87977A2A958 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C87977A2A958 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C87977A2A958 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C87977A2A958 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C87977A2A958 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C87977A2A958 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C87977A2A958 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C87977A2A958 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms