Protein–RNA interactions for Protein: A1L317

Krt24, Keratin, type I cytoskeletal 24, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt24A1L317 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Krt24A1L317 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Krt24A1L317 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Krt24A1L317 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt24A1L317 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt24A1L317 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt24A1L317 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt24A1L317 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt24A1L317 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt24A1L317 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt24A1L317 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt24A1L317 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt24A1L317 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt24A1L317 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt24A1L317 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt24A1L317 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt24A1L317 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt24A1L317 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt24A1L317 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt24A1L317 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt24A1L317 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt24A1L317 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt24A1L317 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt24A1L317 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt24A1L317 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt24A1L317 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt24A1L317 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt24A1L317 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt24A1L317 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt24A1L317 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt24A1L317 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt24A1L317 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt24A1L317 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt24A1L317 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt24A1L317 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt24A1L317 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt24A1L317 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt24A1L317 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt24A1L317 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt24A1L317 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt24A1L317 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt24A1L317 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt24A1L317 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt24A1L317 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt24A1L317 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt24A1L317 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt24A1L317 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt24A1L317 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt24A1L317 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt24A1L317 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt24A1L317 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt24A1L317 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt24A1L317 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt24A1L317 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt24A1L317 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt24A1L317 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt24A1L317 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt24A1L317 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt24A1L317 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt24A1L317 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt24A1L317 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt24A1L317 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt24A1L317 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Krt24A1L317 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt24A1L317 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt24A1L317 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt24A1L317 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt24A1L317 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt24A1L317 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt24A1L317 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt24A1L317 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt24A1L317 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt24A1L317 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt24A1L317 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt24A1L317 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt24A1L317 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt24A1L317 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt24A1L317 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt24A1L317 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt24A1L317 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt24A1L317 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt24A1L317 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt24A1L317 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt24A1L317 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt24A1L317 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt24A1L317 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt24A1L317 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt24A1L317 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt24A1L317 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt24A1L317 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt24A1L317 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt24A1L317 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt24A1L317 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt24A1L317 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt24A1L317 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt24A1L317 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt24A1L317 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt24A1L317 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt24A1L317 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt24A1L317 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms