Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms