Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rasgef1bQ8JZL7 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rasgef1bQ8JZL7 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rasgef1bQ8JZL7 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rasgef1bQ8JZL7 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rasgef1bQ8JZL7 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rasgef1bQ8JZL7 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rasgef1bQ8JZL7 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Rasgef1bQ8JZL7 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rasgef1bQ8JZL7 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rasgef1bQ8JZL7 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rasgef1bQ8JZL7 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rasgef1bQ8JZL7 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rasgef1bQ8JZL7 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rasgef1bQ8JZL7 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rasgef1bQ8JZL7 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rasgef1bQ8JZL7 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rasgef1bQ8JZL7 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rasgef1bQ8JZL7 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rasgef1bQ8JZL7 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rasgef1bQ8JZL7 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rasgef1bQ8JZL7 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rasgef1bQ8JZL7 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rasgef1bQ8JZL7 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rasgef1bQ8JZL7 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rasgef1bQ8JZL7 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rasgef1bQ8JZL7 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rasgef1bQ8JZL7 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rasgef1bQ8JZL7 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rasgef1bQ8JZL7 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rasgef1bQ8JZL7 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rasgef1bQ8JZL7 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rasgef1bQ8JZL7 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms