Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms