Protein–RNA interactions for Protein: Q62147

Sspn, Sarcospan, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SspnQ62147 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SspnQ62147 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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SspnQ62147 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SspnQ62147 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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SspnQ62147 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SspnQ62147 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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SspnQ62147 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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SspnQ62147 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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SspnQ62147 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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SspnQ62147 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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SspnQ62147 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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SspnQ62147 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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SspnQ62147 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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SspnQ62147 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SspnQ62147 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SspnQ62147 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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