Protein–RNA interactions for Protein: Q61220

Nell2, Protein kinase C-binding protein NELL2, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nell2Q61220 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nell2Q61220 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nell2Q61220 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nell2Q61220 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nell2Q61220 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nell2Q61220 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nell2Q61220 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nell2Q61220 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nell2Q61220 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nell2Q61220 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nell2Q61220 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nell2Q61220 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nell2Q61220 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nell2Q61220 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nell2Q61220 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nell2Q61220 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nell2Q61220 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nell2Q61220 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nell2Q61220 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nell2Q61220 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nell2Q61220 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nell2Q61220 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nell2Q61220 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nell2Q61220 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nell2Q61220 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nell2Q61220 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nell2Q61220 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nell2Q61220 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nell2Q61220 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nell2Q61220 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nell2Q61220 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nell2Q61220 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nell2Q61220 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nell2Q61220 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nell2Q61220 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nell2Q61220 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nell2Q61220 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nell2Q61220 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nell2Q61220 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nell2Q61220 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nell2Q61220 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nell2Q61220 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nell2Q61220 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nell2Q61220 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nell2Q61220 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nell2Q61220 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nell2Q61220 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nell2Q61220 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nell2Q61220 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nell2Q61220 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nell2Q61220 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nell2Q61220 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nell2Q61220 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nell2Q61220 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nell2Q61220 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nell2Q61220 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nell2Q61220 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nell2Q61220 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nell2Q61220 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nell2Q61220 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nell2Q61220 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nell2Q61220 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nell2Q61220 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nell2Q61220 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nell2Q61220 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nell2Q61220 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nell2Q61220 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nell2Q61220 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nell2Q61220 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nell2Q61220 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nell2Q61220 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nell2Q61220 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nell2Q61220 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nell2Q61220 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nell2Q61220 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nell2Q61220 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nell2Q61220 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nell2Q61220 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nell2Q61220 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nell2Q61220 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nell2Q61220 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nell2Q61220 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nell2Q61220 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nell2Q61220 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nell2Q61220 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nell2Q61220 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nell2Q61220 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nell2Q61220 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nell2Q61220 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nell2Q61220 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nell2Q61220 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nell2Q61220 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nell2Q61220 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nell2Q61220 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nell2Q61220 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nell2Q61220 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nell2Q61220 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nell2Q61220 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nell2Q61220 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nell2Q61220 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms