Protein–RNA interactions for Protein: Q3U5F4

Yrdc, YrdC domain-containing protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YrdcQ3U5F4 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
YrdcQ3U5F4 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms