Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms