Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
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H2-M1F7CXU4 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
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H2-M1F7CXU4 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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H2-M1F7CXU4 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
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H2-M1F7CXU4 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
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H2-M1F7CXU4 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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