Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms