Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms