Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

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Length 931 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sema6cQ9WTM3 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sema6cQ9WTM3 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sema6cQ9WTM3 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sema6cQ9WTM3 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sema6cQ9WTM3 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sema6cQ9WTM3 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sema6cQ9WTM3 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sema6cQ9WTM3 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sema6cQ9WTM3 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sema6cQ9WTM3 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sema6cQ9WTM3 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sema6cQ9WTM3 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sema6cQ9WTM3 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sema6cQ9WTM3 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sema6cQ9WTM3 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sema6cQ9WTM3 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sema6cQ9WTM3 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sema6cQ9WTM3 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sema6cQ9WTM3 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sema6cQ9WTM3 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sema6cQ9WTM3 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sema6cQ9WTM3 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sema6cQ9WTM3 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sema6cQ9WTM3 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sema6cQ9WTM3 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sema6cQ9WTM3 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sema6cQ9WTM3 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sema6cQ9WTM3 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Sema6cQ9WTM3 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sema6cQ9WTM3 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sema6cQ9WTM3 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sema6cQ9WTM3 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sema6cQ9WTM3 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sema6cQ9WTM3 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sema6cQ9WTM3 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sema6cQ9WTM3 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sema6cQ9WTM3 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sema6cQ9WTM3 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sema6cQ9WTM3 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sema6cQ9WTM3 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sema6cQ9WTM3 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sema6cQ9WTM3 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sema6cQ9WTM3 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sema6cQ9WTM3 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sema6cQ9WTM3 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sema6cQ9WTM3 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Sema6cQ9WTM3 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sema6cQ9WTM3 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Sema6cQ9WTM3 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sema6cQ9WTM3 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sema6cQ9WTM3 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Sema6cQ9WTM3 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sema6cQ9WTM3 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sema6cQ9WTM3 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Sema6cQ9WTM3 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Sema6cQ9WTM3 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sema6cQ9WTM3 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sema6cQ9WTM3 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sema6cQ9WTM3 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sema6cQ9WTM3 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sema6cQ9WTM3 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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