Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
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Usp20Q8C6M1 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Usp20Q8C6M1 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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