Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms