Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprdQ64487 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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PtprdQ64487 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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PtprdQ64487 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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PtprdQ64487 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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PtprdQ64487 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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PtprdQ64487 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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PtprdQ64487 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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PtprdQ64487 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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PtprdQ64487 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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PtprdQ64487 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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PtprdQ64487 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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