Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim28Q62318 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Trim28Q62318 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim28Q62318 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim28Q62318 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Trim28Q62318 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim28Q62318 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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Trim28Q62318 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim28Q62318 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Trim28Q62318 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms