Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Usp39Q3TIX9 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Usp39Q3TIX9 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Usp39Q3TIX9 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Usp39Q3TIX9 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Usp39Q3TIX9 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Usp39Q3TIX9 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Usp39Q3TIX9 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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