Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Gm26474-201ENSMUST00000116762 122 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Gm24380-201ENSMUST00000122696 324 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
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Rpusd2Q149F1 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
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Rpusd2Q149F1 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
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Rpusd2Q149F1 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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Rpusd2Q149F1 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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Rpusd2Q149F1 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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Rpusd2Q149F1 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Rpusd2Q149F1 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Rpusd2Q149F1 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Rpusd2Q149F1 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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