Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.5 ms