Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nphp4P59240 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms