Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP3M2P53677 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms