Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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