Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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UBE3CQ15386 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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UBE3CQ15386 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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UBE3CQ15386 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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UBE3CQ15386 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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UBE3CQ15386 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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UBE3CQ15386 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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UBE3CQ15386 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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