Protein–RNA interactions for Protein: Q06335

Aplp2, Amyloid-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aplp2Q06335 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Aplp2Q06335 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms