Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms