Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CartptP56388 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CartptP56388 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CartptP56388 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CartptP56388 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CartptP56388 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CartptP56388 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CartptP56388 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CartptP56388 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CartptP56388 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CartptP56388 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CartptP56388 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CartptP56388 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CartptP56388 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CartptP56388 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CartptP56388 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CartptP56388 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CartptP56388 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CartptP56388 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CartptP56388 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CartptP56388 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CartptP56388 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CartptP56388 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CartptP56388 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CartptP56388 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CartptP56388 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CartptP56388 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CartptP56388 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CartptP56388 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CartptP56388 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CartptP56388 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CartptP56388 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CartptP56388 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CartptP56388 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CartptP56388 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CartptP56388 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CartptP56388 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CartptP56388 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CartptP56388 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CartptP56388 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CartptP56388 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CartptP56388 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CartptP56388 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CartptP56388 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CartptP56388 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CartptP56388 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CartptP56388 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CartptP56388 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CartptP56388 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CartptP56388 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CartptP56388 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CartptP56388 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CartptP56388 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CartptP56388 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CartptP56388 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CartptP56388 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CartptP56388 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CartptP56388 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CartptP56388 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CartptP56388 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CartptP56388 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CartptP56388 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CartptP56388 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CartptP56388 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CartptP56388 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CartptP56388 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CartptP56388 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CartptP56388 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CartptP56388 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CartptP56388 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CartptP56388 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CartptP56388 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CartptP56388 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CartptP56388 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CartptP56388 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CartptP56388 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CartptP56388 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CartptP56388 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CartptP56388 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CartptP56388 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CartptP56388 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CartptP56388 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms