Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 AC173345.3-201ENSMUST00000221245 1093 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
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