Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms