Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Copb2O55029 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Copb2O55029 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Copb2O55029 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Copb2O55029 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Copb2O55029 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Copb2O55029 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Copb2O55029 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Copb2O55029 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Copb2O55029 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Copb2O55029 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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