Protein–RNA interactions for Protein: O08992

Sdcbp, Syntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdcbpO08992 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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