Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vmn1r167G3UW71 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms