Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 5033428I22Rik-204ENSMUST00000210633 6652 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Mrpl28Q9D1B9 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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