Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms