Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0L9

Gpcpd1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpcpd1Q8C0L9 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gpcpd1Q8C0L9 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gpcpd1Q8C0L9 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gpcpd1Q8C0L9 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gpcpd1Q8C0L9 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gpcpd1Q8C0L9 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gpcpd1Q8C0L9 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gpcpd1Q8C0L9 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gpcpd1Q8C0L9 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gpcpd1Q8C0L9 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gpcpd1Q8C0L9 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gpcpd1Q8C0L9 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gpcpd1Q8C0L9 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gpcpd1Q8C0L9 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gpcpd1Q8C0L9 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gpcpd1Q8C0L9 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gpcpd1Q8C0L9 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gpcpd1Q8C0L9 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gpcpd1Q8C0L9 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gpcpd1Q8C0L9 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gpcpd1Q8C0L9 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gpcpd1Q8C0L9 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gpcpd1Q8C0L9 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gpcpd1Q8C0L9 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gpcpd1Q8C0L9 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gpcpd1Q8C0L9 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gpcpd1Q8C0L9 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gpcpd1Q8C0L9 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gpcpd1Q8C0L9 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gpcpd1Q8C0L9 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpcpd1Q8C0L9 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpcpd1Q8C0L9 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpcpd1Q8C0L9 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpcpd1Q8C0L9 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpcpd1Q8C0L9 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpcpd1Q8C0L9 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpcpd1Q8C0L9 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpcpd1Q8C0L9 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpcpd1Q8C0L9 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpcpd1Q8C0L9 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpcpd1Q8C0L9 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpcpd1Q8C0L9 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpcpd1Q8C0L9 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpcpd1Q8C0L9 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpcpd1Q8C0L9 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpcpd1Q8C0L9 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpcpd1Q8C0L9 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpcpd1Q8C0L9 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpcpd1Q8C0L9 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpcpd1Q8C0L9 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpcpd1Q8C0L9 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpcpd1Q8C0L9 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpcpd1Q8C0L9 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpcpd1Q8C0L9 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpcpd1Q8C0L9 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpcpd1Q8C0L9 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpcpd1Q8C0L9 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpcpd1Q8C0L9 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpcpd1Q8C0L9 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpcpd1Q8C0L9 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpcpd1Q8C0L9 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpcpd1Q8C0L9 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpcpd1Q8C0L9 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpcpd1Q8C0L9 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpcpd1Q8C0L9 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpcpd1Q8C0L9 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpcpd1Q8C0L9 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpcpd1Q8C0L9 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpcpd1Q8C0L9 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms