Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms