Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk2P38575 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk2P38575 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk2P38575 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk2P38575 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk2P38575 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk2P38575 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk2P38575 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk2P38575 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk2P38575 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk2P38575 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk2P38575 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk2P38575 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk2P38575 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk2P38575 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk2P38575 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk2P38575 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk2P38575 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk2P38575 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk2P38575 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk2P38575 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk2P38575 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk2P38575 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk2P38575 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk2P38575 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk2P38575 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk2P38575 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk2P38575 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk2P38575 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk2P38575 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk2P38575 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk2P38575 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk2P38575 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk2P38575 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk2P38575 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk2P38575 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk2P38575 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk2P38575 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk2P38575 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk2P38575 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk2P38575 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk2P38575 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk2P38575 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk2P38575 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk2P38575 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk2P38575 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk2P38575 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk2P38575 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk2P38575 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk2P38575 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk2P38575 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk2P38575 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk2P38575 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk2P38575 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk2P38575 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk2P38575 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Upk2P38575 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Upk2P38575 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Upk2P38575 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Upk2P38575 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Upk2P38575 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Upk2P38575 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Upk2P38575 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Upk2P38575 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Upk2P38575 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Upk2P38575 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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