Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Ggta1P23336 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Ggta1P23336 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Ggta1P23336 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Ggta1P23336 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Ggta1P23336 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Ggta1P23336 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Ggta1P23336 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Ggta1P23336 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
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Ggta1P23336 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Ggta1P23336 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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