Protein–RNA interactions for Protein: P17563

Selenbp1, Selenium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Selenbp1P17563 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Selenbp1P17563 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms