Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Gm20828J3KMI7 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Gm20828J3KMI7 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Gm20828J3KMI7 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Gm20828J3KMI7 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Gm20828J3KMI7 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Gm20828J3KMI7 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Gm20828J3KMI7 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Gm20828J3KMI7 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Gm20828J3KMI7 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Gm20828J3KMI7 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gm20828J3KMI7 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
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