Protein–RNA interactions for Protein: B1AQL3

Tmem235, Transmembrane protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem235B1AQL3 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem235B1AQL3 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms